全自动胶囊充填机在运转时，在*、二工位上胶囊料桶内的胶囊会通过胶囊漏斗逐个的竖直进入送囊板内，先由水平叉推至矫正块外端，再由垂直又及真空吸力顺入模孔中，在真空吸力的作用下并将帽、体分离；第三工位在轨道的作用下，下模块下降并向外运动；第四工位微丸充填，料斗中的微丸通过上、下开关板的开启与闭合动作，将微丸送入下模块里的胶囊体中；第五工位为过渡工位；第六工位用吹气管路将帽体未能分离的残次胶囊剔除，并吹进废囊斗收集处理；第七工位下模块在轨道的作用下向内运动并同时上升；第八工位锁合推杆在凸轮的作用下上升，使已充填的胶囊锁合；第九工位出料推杆在凸轮的作用下上升将锁好的胶囊推出收集；第十工位吸尘器清理模孔后再次进入下一个循环。